Het totale geraamde programmabudget voor Vlaanderen voor Doelstelling 2, in de periode 2007-2013, bedroeg 498 miljoen euro. De EFRO-middelen vertegenwoordigen hierin 200,9 miljoen euro (40%). De overige financiering door het Vlaamse gewest en de regionale en lokale besturen wordt geraamd op 215,14 miljoen euro (45%) enerzijds en op 81,9 miljoen euro (15%) vanwege de privé-sector anderzijds.
Voor elk van de vier prioriteiten was een bedrag van 48,2 miljoen euro EFRO voorzien. Door de steun aan x-aantal projecten werd het grootste deel hiervan al besteed. De financiële tussenkomst van het EFRO betreft de cofinanciering van zowel overheids- als privé-uitgaven en kan maximaal 40% bedragen van de totale subsidiabele projectkosten. Voor de resterende financiering kan beroep worden gedaan op overheids- en privémiddelen, in principe verdeeld conform hierboven. Een eigen inbreng door de projectpromotor is daarbij eveneens principieel aangewezen.