De subsidie wordt aan de onderneming uitbetaald in drie schijven:
Ingeval van achterstallige schulden bij de Rijksdienst voor Sociale Zekerheid of in het kader van subsidiemaatregelen in toepassing van het decreet van 31 januari 2003 betreffende het economische ondersteuningsbeleid, wordt de uitbetaling van de ecologiepremie opgeschort tot de onderneming het bewijs levert dat deze schulden werden aangezuiverd.
De aanvragen tot uitbetaling moeten ingediend worden binnen zes maanden na het beëindigen van de investeringen. Als de investeringen al voor de beslissing tot toekenning van de ecologiepremie beëindigd werden, moeten de aanvragen tot uitbetaling ingediend worden binnen 6 maanden na de beslissing tot toekenning van de ecologiepremie.