In een aantal Interreg programma’s dient een eerste lijn controleur door projectpartners aan het Agentschap Ondernemen voorgesteld te worden voor validatie. Dit is het geval voor de programma’s Noordzee Regio, Noordwest Europa, Interreg IVC en Urbact.
Het Agentschap treedt in dit geval op als unieke goedkeurende instantie in Vlaanderen.
Al de andere programma’s werken met een vaste eerste lijn controleur. Projectpartners hoeven hier zelf niets te ondernemen om een eerste lijn controleur aan te stellen.